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Espacio que se encuentra dentro de la membrana interna que es muy importante para la función de las mitocondriales, en ella se encuentra ADN (ácido desoxirribonucleico), para diferenciarla del ADN que se encuentra en el nucleo de la celula a este se denomina ADN mitocondrial.

En esta parte se forman muchos procesos del metabolismo oxidativo

Está implicado en la translocación molecular y contiene más proteinas que la exterior (80%)

Una bicapa lipídica que permite el paso el moléculas, y esta formada por un 60 o 70% de proteínas