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Transcript

A la découverte du microbiote

(tu n'es pas aussi seul que tu l'imagines...)


Rayan a une otite et son médecin lui prescrit comme antibiotique de l'amoxicilline qui provoque chez lui des troubles intestinaux. On cherche à comprendre l'origine de ces troubles.


A toi de jouer...

Un antibiotique est une substance, d'origine naturelle ou synthétique, utilisée contre les infections causées par les bactéries.

Video

Afin de découvrir ce qu'est le microbiote, visionne ces vidéos en entier, en y étant bien attentif et prends des notes puis explique de part tes connaissances les résultats des expériences des doc 4 et 6.


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Mission 1 : Détermine quelle est la proportion de bactéries présentes dans le corps de Rayan par rapport à ses propres cellules

Colon

Plaque dentaire

Intestin grêle

Salive

Peau

Quantité de bactéries présentes chez Rayan

3.8E+13

1.00E+11

1.00E+07

1.00E+11

1.00E+11

Localisation

Estomac

1.00E+07

Info

1. Calcule la quantité totale de bactéries constituant le microbiote de Rayan


2. Calcule maintenant le nombre de cellules humaines constituant le corps de Rayan

Globules rouges

Muscles

Vaisseaux sanguins

Lymphocytes

Tissus des voies respiratoires

%

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Nombre de cellules humaines de Thomas

7.50E+11

6.30E+11

4.50E+11

3.00E+11

2.40E+11

1.80E+11

1.47E+12

2.52E+13

2.40E+11

3.00E+08

Tissus ou cellules

Graisse

Neurones

Moelle osseuse

Autres

Peau

Plaquettes

Foie

5.40E+11

6.00E+10

Rapport nb de bactéries/nb total de cellules humaines chez un ado du même âge que Rayan = 1.31


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3. Calcule le rapport entre le nombre de bactéries présentes dans le corps de Rayan et le nombre total de cellules humaines que son corps contient.

Puis compare-le au rapport moyen du nb de bactéries chez un ado du même âge. Conclus.

Pour calculer le rapport du nb de bactéries sur le nb total de cellules humaines de Rayan il suffit de diviser le nb total de bactéries calculé précédemment par le nb total de cellules humaines constituant le corps de Rayan, calculé précédemment aussi.


Nb bactéries / nb cellules humaines = rapport à déterminer (sans unité)


On veut maintenant comprendre pourquoi on observe cette différence et pourquoi elle est responsable de troubles intestinaux chez rayan

Mission 2

Les troubles intestinaux fréquemment associés à la prise d'antibiotiques sont des diarrhées, ballonnements et maux de ventre.

Certains antibiotiques agissent de manière ciblée sur certaines bactéries, il s’agit d’antibiotiques à « spectre étroit ». D’autres sont à « spectre large » : ils s‘attaquent à un grand nombre de bactéries.
La prise d'antibiotiques à large spectre ou l’association de plusieurs antibiotiques déséquilibre le microbiote intestinal par la destruction des bactéries bénéfiques. Cette dysbiose (déséquilibre du microbiote) peut entrainer des diarrhées. Jusqu’à 49% des patients traités par antibiotiques souffrent de diarrhées. Elles apparaissent souvent quelques jours après le début de l'antibiothérapie, mais peuvent survenir jusqu'à 6 semaines après son arrêt.

Faire une recherche pour savoir si l’antibiotique prescrit par le médecin est un antibiotique à large spectre ou à spectre étroit.

Les fonctions du microbiote intestinal

Pour aller + loin...

Mission 3 : Explique l'ensemble des bienfaits du microbiote à Rayan..

Angiogénèse : processus de croissance des vaisseaux sanguins permettant d'alimenter (et donc de faire fonctionner) les cellules de l'organisme.

Mission 4 : Explique cette recommandation à partir des données des pastilles. Puis donne d'autres recommandations à Ryan.

Le médecin de Rayan lui a conseillé, pour éviter les troubles intestinaux associés au traitement antibiotique, de consommer des yaourts, du lait fermenté ou des gélules de probiotiques.

Le yaourt

Que contient le yaourt? Découvre le avec ce frottis de yaourt permettant de comprendre ce qu'il contient...

Le lait fermenté

Le kéfir de lait est une boisson fermentée et cultivée qui a un goût qui ressemble beaucoup à celui du yoghourt à boire. Il est fait à partir de ferments qui sont une combinaison de levures et de bactéries. Il a une saveur acidulée et crémeuse, et il est chargé de probiotiques (microorganismes vivants que notre organisme peut héberger après ingestion, en tirant de nombreux bénéfices pour notre santé).


Il est le plus souvent fait avec du lait entier qui peut être du lait de vache , du lait de chèvre ou du lait de brebis. Il peut être fait avec des alternatives non laitières telles que le lait de coco, le lait de riz ou le lait d’amande.

Les bactéries lactiques qu’il contient sont du genre Lactobacillus, elles produisent de l’acide lactique semblable à celui présent dans notre corps.


Autres probiotiques :


  • les légumineuses qui sont sources de fibres (pois cassés haricots rouges, flageolets, lentilles, haricots blancs...)
  • les céréales complètes, également riches en fibres (blé complet, avoine complet, seigle complet, riz sauvage, boulgour, quinoa, épeautre...)
  • les choux fermentés ou la choucroute qui renforcent les bactéries bénéfiques pour les intestins et qui sont riches en calcium, en vitamine C, en phosphore et en potassium.
  • le miel qui est un antibactérien et un antioxydant naturel et qui stimule la prolifération de bonnes bactéries.
  • le kombucha, une boisson gazeuse obtenue par la fermentation de levures et de bactéries cultivées dans du thé vert ou du thé noir.
  • les plantes dont on consomme les bulbes comme l'ail, l'oignon, l'échalote ou le poireau sont des prébiotiques qui servent de nourritures au bactéries et favorisent leur développement.



La TMF

Faire une recherche sur ce qu’est la TMF

En expliquer l’intérêt en lien avec les documents.


Les probiotiques

Faire une recherche internet sur ce qu’est un probiotique et un prébiotique.

Avant/Après la prise d'antibiotiques

Le croquis ci-dessus représente un tronçon du tube digestif de Rayan, avant et après la prise d'antibiotiques. On peut y observer la variation de peuplement du tube digestif par les microorganismes liées au traitement antibiotique.

Effet des probiotiques

Les antibiotiques ont des effets à double tranchant : ils combattent efficacement les infections bactériennes (hors résistances), mais occasionnent des dommages collatéraux aux flores commensales, notamment au microbiote intestinal, et vaginal chez la femme. Les antibiotiques tuent les mauvaises bactéries, mais aussi les bonnes… Les flores protectrices se retrouvant altérées, des bactéries ou champignons pathogènes peuvent se développer et prendre le dessus, occasionnant diarrhée ou bien mycoses vaginales, buccales… Cela veut dire que dès qu’une antibiothérapie est envisagée il faut tout de suite penser à un traitement par probiotiques.

Effet du microbiote sur certaines maladies

Découvrir un lien entre l’hygiène buccaux dentaire avec un AVC:

https://dai.ly/x3stnhz



pour aller plus loin :

https://www.franceinter.fr/sciences/comment-entretenir-son-microbiote-vaginal


Les antibiotiques peuvent agir de deux façons sur le tube digestif : d’une part, certains d’entre eux ont un effet direct sur son fonctionnement, en provoquant des nausées, des vomissements ou des diarrhées (en accélérant le transit intestinal). D’autre part, tous les antibiotiques perturbent la flore intestinale, qu’ils détruisent de manière plus ou moins accentuée. L’équilibre de cette flore étant modifié, la digestion et le fonctionnement de l’intestin sont perturbés. Cela peut provoquer des maux de ventre, des diarrhées ou des ballonnements. Les troubles digestifs peuvent apparaître immédiatement ou après quelques jours de traitement.


Cette photo représente un frottis de yaourt observé au microscope optique. On voit que le yaourt est un lait fermenté qui contient en abondance deux types de bactéries : le streptocoque et le bacille lactique.

« Environ 60 % des cellules du système immunitaire sont concentrées dans l’intestin. Elles jouent un rôle primordial en faisant le tri entre les bactéries nocives et celles qui, au contraire, sont bénéfiques pour la santé. Seulement voilà, le stress, la fatigue, une alimentation déséquilibrée ou la prise d’antibiotiques peuvent perturber la flore intestinale et affaiblir ce système de défense. D’où l’intérêt d’une cure préventive de probiotiques : ces bactéries « amies » vont en quelque sorte occuper la place et laisser le moins possible de voies d’entrée aux germes à l’origine des infections hivernales. »

« Des probiotiques pour garder la forme cet hiver », destinationsante.com, septembre 2016.

Diagramme représentant la durée des troubles intestinaux associés à un traitement antibiotiques en fonction du nombre de capsules de probiotiques consommés quotidiennement par le patient.

Sources : http://espace-svt.ac-rennes.fr/applic/dissect/poisson/pois.htm

RÉALISER UNE DISSECTION
POUR OBSERVER UN MICROBIOTE


Le Matériel de Nadèle :
-La sonde cannelée : sert à guider les ciseaux quand on découpe une épaisseur pour ne pas abîmer les tissus situés sous la ligne de coupe
-La pince fine : sert à maintenir les tissus pendant que l’autre main coupe avec les ciseaux
-La pince fine sert à maintenir les tissus pendant que l’autre main coupe avec les .ciseaux
-le verre de montre permet de récolter le contenu du tube et le diluer dans de l'eau.
-le bleu de méthylène sert à colorer les bactéries.

Le protocole de Nicole :

Observation du microbiote intestinal d’un maquereau : Inciser (1) la paroi abdominale 0.5 cm en avant de l'anus. Poursuivre l'incision sur la ligne médiane jusqu'à l'extrémité antérieure (2) des fentes operculaires, en protégeant les organes sous-jacents avec la sonde cannelée. Inciser (3) très superficiellement le long des fentes operculaires, en arrière de celles-ci. Postérieurement, inciser transversalement (4) la paroi abdominale en évitant soigneusement de léser les organes sous-jacents. Ecarter doucement les deux volets latéraux ainsi obtenus. Découper une portion de tube digestif. Faire sortir comme avec un tube de dentifrice le contenu et le déposer dans le verre de montre avec de l’eau. Récupérer une goutte de suspension et la déposer dans une goutte de bleu de méthylène sur la lame. Après 3 minutes, recouvrir d’une lamelle et observer.

bilan

1. Tu as compris l'origine et les fonctions du microbiote humain
2. Tu as compris où on pouvait le trouver dans notre corps
3. Tu as identifié le rôle des antibiotiques et leurs effets (secondaires) sur le microbiote
4. Tu as compris pourquoi les antibiotiques pouvaient être responsables de troubles digestifs
5. Tu as compris pourquoi certains aliments peuvent aider notre microbiote à remplir ses fonctions lorsqu'on doit suivre un traitement antibiotique

C'est la fin du TP, tu l'as réussi si :

Tu dois avoir sur ta feuille une trace écrite de chacune de ces étapes. Réalise maintenant une carte mentale de toutes tes informations

ATTENTION

Sur ta feuille de classeur consacrée à ce TP vérifie que tu as bien :

- le titre du TP

- le nom de chaque mission et quelques phrases qui résument ce que tu as utilisé comme données et ce que tu as compris au cours de chacune de ces missions