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Défi Anticorps !

"Au XIXe siècle, von Behring a découvert l'existence des anticorps. Leur structure a été décrite en 1959 par Porter à la suite des travaux d'Edelman"

Porter et Edelman ont même reçu le Prix Nobel de physiologie ou médecine en 1972 pour cette découverte !

SAURAS-TU RETROUVER LA STRUCTURE MOLECULAIRE D'UN ANTICORPS ?

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protocole

Etape 2

Geniegen2

Etape 1

Libmol

Etape 3

Libmol

Accès Libmol

Accès Geniegen2

Mise en évidence de la structure globale d’un anticorps


Lancez Libmol et chargez la molécule « Modèle théorique d’un anticorps complet ».

- Via le menu Commandes, modifier le mode de représentation pour distinguer les chaînes LOURDES (HEAVY) et LEGERES (LIGHT)

- Afficher les liaisons fortes entre chaînes (ponts disulfures) via les paramètres (en haut à droite)

- Au survol, repérer le nom des acides aminés soufrés permettant ces ponts


Il est fortement conseillé de faire un schéma au brouillon de vos découvertes, en repérant le vocabulaire à associer aux légendes.

Mise en évidence des zones variables d'un anticorps


Dans Libmol :

- dans le menu Séquence, sélectionner ces acides aminés : H1-120 et L1-?, et choisir un mode de représentation différent (par exemple « sphères »).

- faire de même pour les deux autres chaînes.

Note :

pour sélectionner une série d’acides aminés : touche Maj (ou shift) enfoncée + clic sur le premier et le dernier

pour sélectionner plusieurs acides aminés non côté à côté : touche Ctrl enfoncée + clic sur les AA souhaités.


Vos observations vous permettent de finaliser votre molécule.


Pour les plus rapides (facultatif) : repérez dans une autre couleur les AA hypervariables


Les positions où l’on trouve au moins 4 acides aminés différents pour les 8 chaînes lourdes sont les suivantes : 1, 31-35, 49-58, 62-63, 82, 84-85, 87, 93, 99-106

Les positions où l’on trouve au moins 4 acides aminés différents pour les 9 chaînes légères sont les suivantes : 33-34, 36, 52, 55, 82, 91, 95, 98


Quand vous considérez avoir terminé, appelez le chef de labo avant de capturer, imprimer et légender.



Mise en évidence de la structure détaillée des chaînes H et L d'un d'anticorps


Lancez Geniegen2 : Banque de séquences / Dossiers pédagogiques externes / Structure et fonction des immunoglobulines (anticorps) :

  • Charger ces séquences :

Séquences des 4 chaînes d’un même anticorps

Comparez les séquences des chaînes lourdes. Faites de même avec les chaînes légères. Vos observations vous permettent de compléter votre schéma au brouillon.


  • Charger ces séquences :

Séquences de 8 chaînes lourdes d’individus différents (attention il ne s'agit que des 120 premiers acides aminés)

Comparez les séquences de ces parties de chaînes lourdes avec la chaîne A1 : repérez la forte variabilité de cette partie des chaînes lourdes située entre les AA n°1 et 120.


  • Charger ces séquences :

Séquences de 9 chaînes légères d’individus différents (complètes)

Comparez les séquences des chaînes légères et relevez les numéros des deux acides aminés qui encadrent la zone fortement variable des ces chaînes.



BRAVO !

Bonus : dépose la photo de ton travail dans le dossier de partage sur Pearltrees !