Les microorganismes et l'environnement

Découvrir

@JGorgues

@JGorgues

@JGorgues

@JGorgues

@JGorgues

@JGorgues

@JGorgues

@JGorgues

@JGorgues

L'Histoire de la microbiologie

Les microorganismes pathogènes

La diversité des microorganismes

Tous les microorganismes sont-ils dangereux ?

Définition d'un Microorganisme

Quelle est la place des micro-organismes dans l’environnement ?

Les microorganismes et l'environnement

Qu'est ce qu'un microorganismes ?

Pourquoi dit-on qu'un microorganisme est ubiquitaire ?

@JGorgues

@JGorgues

Une espèce est qualifiée d'ubiquitaire lorsqu'elle se maintient dans des milieux de vie très variées avec une répartition géographique très étendue.

+ Source

Définition Être vivant microscopique tel que les bactéries, les virus, les champignons unicellulaires (levures), les algues et les protistes. (Appelés autrefois microbes, les micro-organismes jouent un rôle essentiel mais certaines espèces sont pathogènes.)Larousse

Définition d'un Microorganisme

Les microorganismes et l'échelle de taille

@JGorgues

@JGorgues

Définition d'un Microorganisme

Quelques uns transmettent des maladies, comme la rougeole ou la grippe, ils sont alors appelés pathogènes. Nous touchons tous les jours de nombreux micro-organismes, c'est pourquoi il est préférable de se laver les mains en cas de salissures ou avant de préparer à manger et de s'alimenter.

Les micro-organismes, ou microbes sont partout, y compris dans notre corps. De très nombreux micro-organismes ne sont pas dangereux (non pathogènes) voire sont utiles (ils facilitent la digestion, par exemple).

Agrandir

Des microorganismes utiles pour l'Homme.

Tous les microorganismes sont-ils dangereux ?

Boite de Pétri

Plasmodium

Microsporum

Coronavirus

Bacille du charbon

Trypanosome

Candida albicans

VIH

Pneumocoque

Paramécie

Levure

Virus de la grippe

Escherichia coli

Trier les microorganismes en familles

La diversité des microorganismes

Parfois pathogène

Escherichia coli, également appelée colibacille et abrégée en E. coli, est une bactérie intestinale (Gram négatif) des mammifères, en forme de bâtonnet, très commune chez l'être humain. E. Coli est une bactérie anaérobie facultative que l'on trouve dans l'intestin des vertébrés. En effet, elle compose environ 80 % de notre flore intestinale aérobie. (...) Cependant, certaines souches d’E. coli peuvent être pathogènes, entraînant alors des gastro-entérites, infections urinaires, méningites.

+ SOURCE

Escherichia coli

Non pathogène

+ Source

La Paramécie, Paramecium, est un protozoaire, genre d'organismes unicellulaires ayant un noyau qui sont couramment utilisées comme organisme modèle dans les laboratoires de microbiologie. On les élève sous forme d'infusoires pour les besoins scolaires (découverte des micro-organismes en sciences naturelles) ou pour nourrir les alevins de jeunes poissons (aquariophilie).La taille de la cellule varie de 0,1 à 0,3 mm de long suivant les espèces.La paramécie utilise des cils pour se déplacer et se nourrir (essentiellement de bactéries, par phagocytose).

Paramécie

Parfois pathogène

Une levure est un champignon unicellulaire apte à provoquer la fermentation des matières organiques animales ou végétales. Les levures sont employées pour la fabrication du vin, de la bière, des alcools industriels, des pâtes levées, des antibiotiques (...).Le terme courant de levure désigne généralement le genre Saccharomyces (levure de bière ou levure de boulanger). Il existe beaucoup d'autres genres de levures ; parmi les plus connues, le genre Candida possède un pouvoir pathogène chez l'homme, responsable des mycoses de type candidoses.

+ SOURCE

Levure

Pathogène

+ Source

La grippe (ou influenza) est une maladie infectieuse fréquente et contagieuse causée par certains virus (...) : le virus de la grippe A, le virus de la grippe B, le virus de la grippe C et le virus de la grippe. Elle touche les oiseaux et certains mammifères dont le porc, le phoque et l'être humain.Elle sévit sur un mode épidémique saisonnier essentiellement automno-hivernal dans les pays tempérés, permanent dans des pays tropicaux comme le Cameroun. Elle se traduit chez l'être humain par un ensemble de signes non spécifiques associant fièvre, céphalées, toux, pharyngite, myalgies, asthénie et anorexie. (...) Dans les cas les plus sérieux, la grippe est grevée de complications (au premier rang desquelles les pneumonies bactériennes et la déshydratation) possiblement fatales.

Virus de la grippe

Pathogène

Streptococcus pneumoniae (le pneumocoque) est une espèce de bactérie du genre Streptococcus. C'est un important agent pathogène chez l'humain. Il est notamment responsable de nombreuses co-infections : il a, par exemple, aggravé la mortalité lors de la pandémie de grippe espagnole. À cause de son implication comme agent pathogène dans les pneumonies, il a longtemps été dénommé simplement pneumocoque.Les infections à pneumocoque sont particulièrement dangereuses et nécessitent très souvent une hospitalisation, avec des taux de mortalité compris entre 8% et 15%.

+ SOURCE

Pneumocoque

Pathogène

Agrandir

+ Source

Le virus de l'immunodéficience humaine ou VIH (en anglais, human immunodeficiency viruses ou HIV) est un rétrovirus infectant l'humain et responsable du syndrome d'immunodéficience acquise (SIDA), qui est un état affaibli du système immunitaire le rendant vulnérable à de multiples infections opportunistes.Transmis par plusieurs fluides corporels (sang, sécrétions vaginales, sperme ou lait maternel), le sida est aujourd'hui considéré comme une pandémie ayant causé la mort d'environ 32 millions de personnes entre 1981 (date de la première identification de cas de sida) et 2018.

VIH

Pathogène

Microsporum est un genre de champignons filamenteux.Certaines espèces de ce genre sont des parasites fongiques de la peau, des ongles, des poils... de l'animal et/ou de l'Homme. C'est par exemple un Microsporum qui cause la teigne la plus courante (ex : tinea corporis, et d'autres Microsporum dont à l'origine de plusieurs infections fongiques de la peau fréquentes chez l'homme ou certains animaux.

+ SOURCE

Microsporum

Pathogène

+ Source

Trypanosoma brucei est une espèce de parasites protozoaires de l'ordre des Trypanosomatida. L'espèce provoque des maladies, des trypanosomiases chez l'humain et les animaux en Afrique. Il est transmis par des morsures de mouche tsé-tsé. (...)La Trypanosomiase Humaine Africaine, ou la maladie du sommeil, est une maladie mortelle chez l'Homme. Elle existe sous deux formes. La forme 'chronique' est causée par la sous-espèce Trypanosoma brucei gambiense et a une installation lente avec une longue période d'incubation. La forme aigüe est causée la sous-espèce Trypanosoma brucei rhodesiense.

Trypanosome

Pathogène

La maladie du charbon, également appelée fièvre charbonneuse, est une maladie infectieuse aiguë causée par la bactérie Bacillus anthracis. C'est une anthropozoonose, c'est-à-dire commune aux animaux et à l'homme. Très rare chez l'homme, elle s'observe le plus souvent chez les animaux herbivores.Bacillus anthracis est une arme bactériologique potentielle depuis la fin de la Seconde Guerre mondiale et a été particulièrement médiatisée à la suite des attentats du 11 septembre 2001.

+ SOURCE

Bacille du charbon

SARS-CoV-2

Pathogène

+ Source

SARS-CoV-2 (acronyme anglais de severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) est le sigle du virus du syndrome respiratoire aigu sévère. (...) Ce coronavirus hautement pathogène, découvert en décembre 2019 dans la ville de Wuhan (province de Hubei, en Chine). (...)C'est l'agent pathogène à l'origine d'une pneumonie atypique émergente, la maladie à coronavirus 2019 (Covid-19). La progression de cette maladie a conduit l'Organisation mondiale de la santé (OMS) à la déclarer urgence de santé publique de portée internationale le 30 janvier 2020, puis pandémie le 11 mars 2020. Les symptômes rapportés évoquent grossièrement ceux de la grippe saisonnière : fièvre, fatigue, toux sèche, manque de souffle, difficultés à respirer, pneumonie, insuffisance rénale se concluant par la mort dans les cas sévères.

Coronavirus

Pathogène

Candida albicans est un organisme vivant à l'état naturel dans les muqueuses de l'être humain. On le retrouve dans le tube digestif de 70% des adultes sains, et il n'entraîne habituellement aucune maladie ou symptôme en particulier. (...)Ce champignon pathogène provoque des infections fongiques (candidiase ou candidose) essentiellement au niveau des muqueuses digestive et gynécologique.Les candidoses sont une cause importante de mortalité chez les patients immunodéprimés comme les patients atteints du sida, les patients cancéreux sous chimiothérapie ou après transplantation de moelle osseuse.

+ SOURCE

Candida albicans

Pathogène

+ Source

Le paludisme est dû à un protozoaire parasite de genre Plasmodium, principalement transmis d’homme à homme par le biais d’une piqûre d’un moustique, l’anophèle femelle. De façon moins courante, le Plasmodium peut aussi être transmis au cours d’une transfusion sanguine ou entre la mère et l’enfant à la fin de la grossesse.Il existe cinq espèces de Plasmodium différentes infectant l’homme : Plasmodium falciparum, Plasmodium vivax, Plasmodium ovale, Plasmodium malariae et Plasmodium knowlesi. Elles se différencient par la zone géographique où elles sévissent et par le profil de symptômes auxquelles ils exposent.

Plasmodium

Trions les microorganismes

La diversité des microorganismes

virus

Protozoaires

Champignons

Bactéries

Les 4 principales familles de microorganismes

Agrandir

Ceux qui entraînent des maladies

+ Source

Les microorganismes pathogènes

Les micro-organismes peuvent aussi être la cause de nombreuses maladies infectieuses : ils sont appelés pathogènes. On distingue ainsi les bactéries pathogènes qui provoquent des maladies comme la peste, la tuberculose et le charbon, les protozoaires responsables de maladies comme le paludisme, la maladie du sommeil et la toxoplasmose et les champignons qui provoquent des maladies telles que la teigne, la candidose ou histoplasmose.D'autres maladies comme la grippe, la fièvre jaune ou le SIDA sont causées par des virus pathogènes qui ne sont généralement pas classés comme des organismes vivants et ne sont donc pas des micro-organismes au sens strict du terme. Heureusement, nous possédons des barrières naturelles (la peau et les muqueuses) dont le rôle est d'empêcher la contamination. Elles évitent que les micro-organismes ne pénètrent dans le milieu intérieur, évitant ainsi l'infection. Si ces barrières sont traversées, le système immunitaire fait face aux microorganismes pathogènes.

+ Définition

Dossier "Pandémie"

Histoires de pandémies

Les microorganismes pathogènes

+ DéfinitionS

Dossier "Vaccination"

Des vies sauvées grâce à la vaccination

Les microorganismes pathogènes

Hygiène

Génération spontanée ?

Cellule & microscope

Alexander Fleming découvre la penicilline, premier antibiotique(contre les bactéries)

Antibiotique

1928

Emil von Behring identifie un élément présent dans un organisme capable d'immuniser la diphtérie, une antitoxine. Paul Ehrlich en 1897 leur donnera le nom d'anticorps.

Anticorps

1890

Louis Pasteur vaccine et soigne des malades de la rage causée par un virus. Il imagine un protocole de vaccination.

RAGE

1885

Robert Koch identifie la bactérie responsable de la tuberculose (Bacile de Koch)

Tuberculose

1884

Edward Jenner trouve la vaccine et soigne des malades de la variole.

Vaccination

1796

Louis Pasteur diminue les effets de la bactérie responsable du choléra de la poule

Choléra de la poule

1880

Joseph Lister isole et cultive la bactérie à l'origine de la fermentation lactique.

Fermentation lactique

1878

Antoni van Leeuwenhoek (1632 – 1723) observe les microorganismes pour la 1ère fois (invention du microscope)

Premières observations

1674

Découverte des microorganismes - fin de la génération spontanée

L'histoire de la microbiologie