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Consejos Análisis de Fragmentos

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Consejos Análisis de Microsatélites

Servicio de SecuenciaciónSanger de ADN

Gioconda PeraltaLoreto Carrasco

Te invitamos a ver este video, en el cual entregamos algunos consejos sobre microsátelites que pueden ser de utilidad.

El servicio utiliza la matriz DS-33, la cual permite visualizar los fluoróforos que se indican en la imagen. Fluoróforos alternativos no se resuelven correctamente con esta matriz.

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La forma de los peaks depende de un buen diseño de partidores y de una correcta optimización del PCR. Con esto evitamos la generación de bandas inespecifícas que dificultan la determinación del tamaño alélico.

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Antes de enviar las muestras al servicio, se recomienda verificar que el tamaño del fragmento amplificado coincida con el rango de tamaño esperado.

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En el caso de una mezcla de loci, lo ideal es verificar que la intensidad de las señales en la mezcla sea similar. Cuando esto no ocurre, puede no observarse la señal más débil.

Evitar elegir fragmentos cuyo tamaño sea inferior a 100 pb, dado que se confunden con dímeros de partidor o amplificaciones inespecíficas.

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Si es primera vez que envía muestras al servicio, es posible hacer una prueba sin costo para evaluar la intensidad de sus partidores en la mezcla.

Esperamos que estos consejos les sean de utilidad.

Si tienes dudas contáctanos ytrataremos de ayudarte.secuencias@bio.puc.cl

Contacto

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Gracias por vernos!