Coccinelles

Tout le monde connait la coccinelle Coccinella septempunctata, une grande habituée de nos jardins...

Mais connaissez-vous les coccinelles arlequins ? Il s'agit de coccinelles présentant des motifs variés sur leurs élytres (la carapace protégeant leurs ailes).Il s'agit d'un bon exemple de diversité des êtres vivants...

Le but de cette séance est de :-Savoir s'il s'agit de variations intraspécifiques (au sein d'une même espèce) ou spécifiques (plusieurs espèces différentes).-Savoir si les coccinelles arlequins sont de la même espèce que Coccinella septempunctata.-Connaitre l'origine précise de cette variabilité.

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La notion d'espèce

Notions de génétique

Faire des croisements

Localiser et inactiver des gènes

Séquencer l'ADN

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Avec des méthodes statistiques, il est possible de connaitre la région approximative d'un chromosome responsable d'un certain caractère (ici les motifs des élytres de la coccinelle).

Connaitre la région responsable du motif des élytres

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Nous avons identifié une région bien précise du chromosome 4 de la coccinelle arlequin, dont les variations de séquences sont corrélées avec les variations de coloration. Cette région s’étend sur trois gènes : le gène aor, le gène pnr et le gène itr Pour pouvoir trancher entre ces trois gènes, il y a possibilité d’inactiver chaque gène et d’observer les effets sur les caractéristiques de la coccinelle.

Avec des méthodes statistiques, il est possible de connaitre la région approximative d'un chromosome responsable d'un certain caractère (ici les motifs des élytres de la coccinelle).

Connaitre la région responsable du motif des élytres

Inactiver le gène aor

Inactiver le gène pnr

Inactiver le gène itr

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Black-4spots

Red-nspots

Black-nspots

Black-2spots

Black-4spots

Red-nspots

Black-nspots

Black-2spots

Gène aor actif(expérience témoin)

Gène aor inactif

Expérience d'inactivation du gène aor

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Black-4spots

Red-nspots

Black-nspots

Black-2spots

Black-4spots

Red-nspots

Black-nspots

Black-2spots

Gène pnr actif(expérience témoin)

Gène pnr inactif

Expérience d'inactivation du gène pnr

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Refaire une expérience d'inactivation

Black-4spots

Red-nspots

Black-nspots

Black-2spots

Black-4spots

Red-nspots

Black-nspots

Black-2spots

Gène itr actif(expérience témoin)

Gène itr inactif

Expérience d'inactivation du gène itr

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Refaire une expérience d'inactivation

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Entrez le chiffre correspondant au chromosome concerné par le séquencage.

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

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___

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

Recommencer le séquencage

x__

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

Recommencer le séquencage

xx_

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

Recommencer le séquencage

___

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

Recommencer le séquencage

x__

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

Recommencer le séquencage

xx_

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La séquence d'ADN demandée a bien été séquencée.Il existe 4 versions (allèles) de ce gène pnr ("pannier"): hsp : allèle trouvé chez Black-4spots hA : allèle trouvé chez Black-nspots hC : allèle trouvé chez Black-2spots h : allèle trouvé chez Red-nspots

Recommencer le séquencage

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Obtenir séquence

Une fois dans le logiciel, vous devrez :-Aligner les séquences, pour mieux pouvoir les comparer (Action => aligner les séquences).-Afficher le tableau de comparaison des distances génétiques (Affichage => tableau de comparaison).

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

ERREUR : ce n'est pas le bon gène

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Sélectionnez les coccinelles que vous voulez croiser...

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ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

Coccinella septempunctata

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

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Autre croisement

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

Coccinella septempunctata

+

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Autre croisement

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

Coccinella septempunctata

+

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Autre croisement

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

Coccinella septempunctata

+

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Autre croisement

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

Coccinella septempunctata

+

Pas de croisement possible

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Autre croisement

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ArlequinRed-nspots

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Coccinella septempunctata

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

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Autre croisement

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Coccinella septempunctata

+

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Autre croisement

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Coccinella septempunctata

+

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Autre croisement

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Coccinella septempunctata

+

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Autre croisement

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ArlequinBlack-nspots

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Coccinella septempunctata

+

Pas de croisement possible

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ArlequinRed-nspots

ArlequinBlack-nspots

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Coccinella septempunctata

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

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ArlequinRed-nspots

ArlequinBlack-nspots

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Coccinella septempunctata

+

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Autre croisement

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ArlequinRed-nspots

ArlequinBlack-nspots

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Coccinella septempunctata

+

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Autre croisement

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Coccinella septempunctata

+

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Coccinella septempunctata

+

Pas de croisement possible

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Coccinella septempunctata

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

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Coccinella septempunctata

+

Pas de croisement possible

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Coccinella septempunctata

+

Pas de croisement possible

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Coccinella septempunctata

+

Pas de croisement possible

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Coccinella septempunctata

+

Pas de croisement possible

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Coccinella septempunctata

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

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Coccinella septempunctata

+

Pas de croisement possible

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Coccinella septempunctata

+

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Coccinella septempunctata

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Coccinella septempunctata

+

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Coccinella septempunctata